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科研人員初步建立青藏高原水生微生物基因組和基因目錄

發(fā)布時(shí)間:2024-02-22 16:11:00來(lái)源: 中國(guó)新聞網(wǎng)

  中新社武漢2月21日電 (馬芙蓉 孫慧)中國(guó)科研人員搜集來(lái)自青藏高原濕地、淡水湖、鹽水湖、河流、溫泉和冰川等六種水生生態(tài)系統(tǒng)的498個(gè)水體環(huán)境DNA樣本,并進(jìn)行宏基因組測(cè)序,初步建立了青藏高原水生微生物基因組和基因目錄。相關(guān)成果于近日發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然-通訊》。

  這項(xiàng)工作由中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所研究員繆煒與華中科技大學(xué)團(tuán)隊(duì)合作完成??姛?1日受訪時(shí)表示,上述基因組和基因目錄作為高海拔水生微生物資源的重要資源庫(kù),蘊(yùn)藏著發(fā)現(xiàn)新的微生物譜系和功能的潛力,有助于拓展對(duì)全球微生物物種、遺傳和功能多樣性的認(rèn)識(shí)。

  青藏高原是世界海拔最高的高原,獨(dú)特地形特征使其成為眾多河流的主要源頭,被譽(yù)為“亞洲水塔”。其類型多樣的水生態(tài)系統(tǒng),孕育著豐富的水生微生物。

  研究團(tuán)隊(duì)耗時(shí)4年,初步建立了青藏高原水生微生物基因組和基因目錄(Tibetan Plateau Microbial Catalog,簡(jiǎn)稱“TPMC”)??姛樈榻B,TPMC目前包含3萬(wàn)多個(gè)中高質(zhì)量的原核微生物(細(xì)菌和古菌)宏基因組組裝的基因組,聚類為1萬(wàn)多個(gè)物種,其中88%為未注釋物種。此外,包含近3億個(gè)非冗余基因,其中15%為新基因;7萬(wàn)多個(gè)生物合成基因簇,50%為新基因簇。

  利用這些數(shù)據(jù),研究團(tuán)隊(duì)分析發(fā)現(xiàn),青藏高原微生物組的微生物組成相似性和共有基因數(shù)量,隨著距離和海拔的差異增大而下降?!斑@一微生物的傳播模式提示青藏高原可能不僅扮演著‘水塔’的角色,還具有‘微生物塔’的作用?!笨姛樥f(shuō)。

  繆煒表示,此項(xiàng)研究是中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所牽頭發(fā)起的“萬(wàn)種原生生物基因組計(jì)劃”進(jìn)展之一。相關(guān)原核微生物基因組目錄已發(fā)布于國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心。(完)

(責(zé)編:陳濛濛)

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