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納米孔靶向測序精準(zhǔn)“獵毒”

杜巍巍 發(fā)布時間:2020-07-20 11:00:00來源: 健康報

  近日,國際期刊《微尺度》在線發(fā)表武漢大學(xué)人民醫(yī)院檢驗醫(yī)學(xué)團(tuán)隊有關(guān)納米孔靶向測序檢測新冠病毒方法的最新研究成果,并將其選為當(dāng)期封面文章。這種新型檢測方法改以往的單一“狙擊”為普遍“撒網(wǎng)”,大大提升了病毒核酸的捕獲概率、病毒陽性檢出率和分型效率。

  今年1月,在武漢新冠肺炎疫情暴發(fā)初期,暴露出RT-qPCR檢測試劑盒用于新冠病毒核酸檢測“假陰性”率較高,且無法同時檢測其他秋冬季高發(fā)、癥狀與新冠肺炎相似的呼吸道病毒的問題。

  為此,武漢大學(xué)人民醫(yī)院檢驗科李艷教授、心血管內(nèi)科余鋰鐳教授和武漢大學(xué)藥學(xué)院劉天罡教授等迅速組建聯(lián)合團(tuán)隊,開發(fā)了納米孔靶向測序檢測方法,綜合病毒靶向擴增和納米孔測序長讀長、實時數(shù)據(jù)輸出、高敏感性、高準(zhǔn)確性的優(yōu)勢,首次實現(xiàn)6小時~10小時內(nèi)同時檢測SARS-CoV-2和其他10大類、40余種呼吸道病毒。同時,該方法可對新冠病毒基因組變異情況進(jìn)行檢測,監(jiān)控病毒的突變,對病毒進(jìn)行分型。

  李艷介紹,用RT-qPCR檢測核酸,好比用一把狙擊槍射擊樣本中的病毒核酸,有較大的概率打不中而造成假陰性率較高,而核酸檢測納米孔靶向測序則是撒網(wǎng),并且同時撒十幾張網(wǎng)。這一方式突破了以往國內(nèi)外疾病控制中心在RT-qPCR方法中推薦的少數(shù)位點,將檢測范圍擴大到9個基因、12個位點近1萬個堿基(10 kb)區(qū)域,全面覆蓋病毒基因組上主要基因區(qū)域,100%覆蓋病毒基因組上毒力相關(guān)的重要基因,大大增加了捕獲病毒核酸的概率,從而顯著提高檢測的敏感性和準(zhǔn)確性。

  同時,NTS所采用的目前最為快速的測序技術(shù)——納米孔測序,能在捕獲病毒核酸的同時讀出其序列,不但能檢測出是否感染新冠病毒,還能同時檢測出其他常見的呼吸道病毒。更重要的是,這種方法能檢測在病毒傳播期間與毒力相關(guān)的基因是否發(fā)生突變,對病毒進(jìn)行分型,從而迅速為后續(xù)的流行病學(xué)分析提供信息,對臨床病人的診療提供指導(dǎo)。

  李艷介紹,NTS檢測法從1月開始研發(fā),2月初即在武漢大學(xué)人民醫(yī)院檢驗科率先測試應(yīng)用并迅速推廣到抗疫一線醫(yī)院,提升了新冠病毒核酸檢測精準(zhǔn)度,為武漢實現(xiàn)“應(yīng)收盡收、應(yīng)治盡治”的防疫策略作出了重大貢獻(xiàn)。

(責(zé)編: 賈春玲)

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