迄今最大最全人肺細(xì)胞圖譜公布
科技日報(bào)北京6月8日電 (記者張佳欣)迄今最大、最全面的人類肺細(xì)胞圖譜8日發(fā)表在《自然·醫(yī)學(xué)》雜志上。通過結(jié)合近40項(xiàng)研究的數(shù)據(jù),一個國際研究團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建了第一個完整的肺單細(xì)胞圖譜,揭示了肺部細(xì)胞類型的豐富多樣性,其突出了健康與患病肺部的關(guān)鍵細(xì)胞差異,將成為肺部研究人員的寶貴資源。
研究發(fā)現(xiàn)了肺纖維化、癌癥和新冠肺炎之間的共同細(xì)胞狀態(tài),為理解肺部疾病提供了新的途徑,有助于確定新的治療靶點(diǎn)。
這項(xiàng)研究是全球人類細(xì)胞圖譜計(jì)劃(HCA)的一部分,該計(jì)劃旨在繪制人體內(nèi)的每一種細(xì)胞類型,以改變?nèi)藗儗】怠⒏腥竞图膊〉睦斫狻?/p>
研究團(tuán)隊(duì)使用先進(jìn)的機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),成功地將來自近40項(xiàng)獨(dú)立研究的49個肺部數(shù)據(jù)集組合成一個單一的綜合圖譜。通過匯集和整合迄今為止發(fā)表的每一項(xiàng)主要單細(xì)胞RNA測序肺研究的數(shù)據(jù)集,該團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建了第一個整合的人類肺細(xì)胞圖譜。這份圖譜涵蓋了來自486個個體的240多萬個細(xì)胞,提供了對肺部生物學(xué)前所未有的新見解。
論文資深作者、德國亥姆霍茲慕尼黑研究中心計(jì)算生物學(xué)研究所所長法比安·泰斯教授介紹說,第一個人類肺部的參考圖譜包括來自100多名健康人的數(shù)據(jù),揭示了個人的細(xì)胞如何隨著年齡、性別和吸煙史的變化而變化。而最新研究使人們能看到稀有的細(xì)胞類型,并識別以前沒有發(fā)現(xiàn)的新細(xì)胞狀態(tài)。
雖然人類肺細(xì)胞圖譜的核心是來自健康肺部的數(shù)據(jù),但該團(tuán)隊(duì)也從十多種不同的肺部疾病中提取了數(shù)據(jù)集,并將這些數(shù)據(jù)投射到健康數(shù)據(jù)中,以了解疾病狀態(tài)。
該團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn),不同的肺部疾病具有共同的免疫細(xì)胞狀態(tài),在肺纖維化、癌癥和新冠肺炎中,巨噬細(xì)胞(一種免疫細(xì)胞)的一種亞群具有相似的基因活動。其共同的狀態(tài)表明,這些細(xì)胞可能在這3種疾病的肺部疤痕形成中發(fā)揮類似的作用,并為潛在的治療靶點(diǎn)提供參考。
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