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AI預(yù)測(cè)超過(guò)2億個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

發(fā)布時(shí)間:2022-08-02 09:47:00來(lái)源: 科技日?qǐng)?bào)

  科技日?qǐng)?bào)北京7月31日電(記者劉霞)據(jù)英國(guó)《新科學(xué)家》雜志網(wǎng)站近日?qǐng)?bào)道,總部位于英國(guó)的人工智能公司“深度思維”宣布,將公布超2億個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。該公司在短短18個(gè)月內(nèi),憑借“阿爾法折疊”算法,預(yù)測(cè)了迄今被編目的幾乎所有蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),破解了生物學(xué)領(lǐng)域最重大的挑戰(zhàn)之一,將助力應(yīng)對(duì)抗生素耐藥性、加速藥物開發(fā)并徹底改變基礎(chǔ)科學(xué)。

  幾十年來(lái),根據(jù)氨基酸序列確定蛋白質(zhì)形狀一直是生物學(xué)領(lǐng)域的一大難題。2020年底,“深度思維”宣布,該公司的“阿爾法折疊”算法能準(zhǔn)確預(yù)測(cè)折疊蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu);2021年中,該人工智能已經(jīng)能繪制人體內(nèi)98.5%的蛋白質(zhì)。近日,該公司宣布將公布超2億個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),幾乎所有這些蛋白質(zhì)都被編入全球公認(rèn)的蛋白質(zhì)研究庫(kù)UniProt。

  “深度思維”也在與歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室下屬歐洲生物信息學(xué)研究所合作,創(chuàng)建一個(gè)可搜索數(shù)據(jù)庫(kù)“阿爾法折疊蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)”,研究人員可輕松、自由地訪問(wèn)相關(guān)信息,使搜尋蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變得幾乎和網(wǎng)絡(luò)搜索工具一樣簡(jiǎn)單。

  很多科學(xué)家正在利用“阿爾法折疊”推進(jìn)多個(gè)領(lǐng)域的研究,如牛津大學(xué)的馬特·希金斯等人正在研究一種他們認(rèn)為是中斷瘧疾寄生蟲生命周期的關(guān)鍵蛋白質(zhì),希望研制出有效的瘧疾疫苗;也有科學(xué)家用其設(shè)計(jì)新酶來(lái)分解塑料垃圾,并進(jìn)一步了解使細(xì)菌對(duì)抗生素產(chǎn)生耐藥性的蛋白質(zhì)。

  倫敦帝國(guó)理工學(xué)院的基思·威廉姆森表示,“阿爾法折疊”改變了生物學(xué)研究,但仍存在一些問(wèn)題,如它無(wú)法提取任意氨基酸序列,并精確模擬它們的折疊方式,也無(wú)法揭示蛋白質(zhì)之間復(fù)雜的相互作用,另外,其在準(zhǔn)確性方面還有待改進(jìn)。

  “深度思維”公司表示,目前正致力于提高該工具的準(zhǔn)確性,以進(jìn)一步了解蛋白質(zhì)如何生成以及細(xì)胞如何工作。

(責(zé)編: 常邦麗)

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